先頭に半角空白があるファイルをFTPサーバにアップロードすると、各種クライアント（FFFTPで検証）が対応していないのか、ダウンロードは元より、削除や移動もできなくなり詰みます。
ちなみに、Explorerのアドレスバーにftp://〜と入力することで簡易なFTPクライアントとしても使えますが、そちらでもエラーが発生します。
エラーメッセージ例
550 The system cannot find the file specified.
FTPサーバのファイルまたはフォルダーを削除しようとしてエラーが発生しました。このフォルダーへのアクセス許可があるかどうかを確認してください。
対応方法
コマンドプロンプトでftpコマンドを使って接続し、ファイル名をダブルクォーテーションで囲って指定することで削除（delete）や移動ができます。
$ ftp xxx.xxx.xxx.xxx > delete " filename.msg"
Explorerからは先頭空白のファイル名を付与できませんが、WindowsAPI経由では可能のようです。今回の私の場合は、Microsoft Office Outlookのメールをファイルとして保存すると、ファイル名の先頭に半角空白が紛れ込みました。